1、先到工商行政管理机关申请公司名称预先核准。
2、核定名称后带其资料到当地卫生行政部门（有的地区是食品药品监督部门）申请办理食品卫生许可证。
以上针对的是销售保健品的单位，如果涉及生产，需要向当地质量技术监督部门申请办理食品生产企业卫生许可证。
具体流程以当地公示的信息或者向行政机关进行咨询。
保健食品流通许可证怎么办理呢？
办理食品流通许可证所需条件：
一、具有与经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、包装、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其他污染源保持规定的距离；
二、具有与经营的食品品种、数量相适应的设备或者设施，有相应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施；
三、有食品安全专业技术人员、管理人员和保证食品安全的规章制度；
四、具有合理的设备布局和工艺流程，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物。
食品流通许可证办理需要的材料：
一、《食品流通许可申请书》（盖章签字）；
二、与食品经营相适应的经营场所的使用证明；
三、《名称预先核准通知书》复印件；
四、与食品经营相适应的经营设施空间布局和操作流程的文件；
五、负责人及食品安全管理人员的身份证明；
六、与食品经营相适应的经营设备、工具清单；
七、食品安全管理制度文本；
八、省、自治区、直辖市工商行政管理局规定的其他材料；
九、营业执照等主体资格证明材料。
办理食品流通许可证的部门为：地方各级工商行政管理机关的许可管辖分工由省、自治区、直辖市工商行政管理局。
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