食品流通许可证在哪个部门办理

食品经营许可证在申请人所在地县级以上地方食品药品监督管理部门办理。食品经营许可证的申请流程如下：
1、首先填写好食品经营许可证的申请表；
2、准备法人身份证复印件、从业人员身份证复印件和健康证。然后制定食品安全管理制度；
3、绘制店铺的平面图。提交缴纳税费单据证明，证实自己所使用的水是正规自来水公司提供的；
4、到当地市场监督管理局提交相关材料；
5、资料提交成功之后，市场监督管理局会安排人员来看场地；
6、检查通过后，在一定时间内通知申请人来领取食品经营许可证。
办理食品流通经营许可证需要的材料如下：
1、营业执照原件及复印件；
2、经营者的身份证原件及复印件；
3、经营者及从业人员健康证原件及复印件；
4、食品安全管理人员身份证复印件及培训证明资料。
法律依据：《中华人民共和国食品安全法》第二十七条
食品安全国家标准由国务院卫生行政部门会同国务院食品安全监督管理部门制定、公布，国务院标准化行政部门提供国家标准编号。
食品中农药残留、兽药残留的限量规定及其检验方法与规程由国务院卫生行政部门、国务院农业行政部门会同国务院食品安全监督管理部门制定。
屠宰畜、禽的检验规程由国务院农业行政部门会同国务院卫生行政部门制定。