二者还是有很大区别的：
所谓的个人独资企业转让应该是100%股权转让，在转让协议里注意约定两点，1、转让人承诺转让公司未对外承担任何债务；
2、若在公司转让前确有债务发生或应付，则转让人同意用转让收入予以偿还，与被转让公司和受让人无任何关联个人公司转让。
第一点的主要目的是说明受让人是善意的，并不知道转让人有债务，否则有损债权人的利益。在第一点的基础上第二点可以切断这种债权债务关系。
个人独资企业营业转让的形式为两种，一是全部转让，原投资人退出企业，由新的投资人进行工商登记变更，企业性质和名称不改变，仅仅只是由新的投资人对个人独资企业的整体（包括全部资产和企业经营所需的一切部分）接收；另一种是部分转让，是原投资人仅将企业营业部分转让出去，自己并不退出企业，此种情形将出现多个投资人，从而导致企业类型的根本改变。
公司转让需要什么手续，特别是工商和税务？
公司转让，写好章程修正案，股东会决议，还有股权转让协议，再去工商拿相关表格回来填写，所有资料签字盖章准备好后，连同营业执照一起提交到工商局，提交上去，大概需要五个工作日，在这几天内可以去刻一个新的法人章，就领到新的营业执照个人公司转让！
领到新的营业执照后，去银行办理基本户开户变更，变更时要带着新章和旧章还有旧的印鉴卡，因为变更新的资料银行要验印
基本户变根据银行不同一般需要7-10个工作日，基本户变更好，再去税务做一个变更，公司如果有一般户一般户也要变更，大致就这些
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