一、财务收支审计与效益审计相结合。
在专项资金审计中，应积极探索将财政收支审计与效益审计融合的有效策略，这是审计工作的核心。通过综合评估专项资金的经济效益与社会效益，提出针对性的意见与建议，旨在完善政策法规、工作流程与管理，从而更好地服务宏观经济。
二、综合审计与重点审计相结合。
要确保审计资金的全面覆盖和项目细节的深入分析，避免审计视野的盲点和死角，这样才能全面掌握专项资金的使用情况。同时，针对管理与使用中的薄弱环节和主要问题，应深入挖掘账外深层次问题，确保审计工作质量。
三、专项资金审计与其他审计工作相结合。
在实际操作中，可以将专项资金审计与预算执行审计、经济责任审计等其他审计工作相整合，以加强资金管理与使用的监督，跟踪审计决策与建议的实施情况，促使被审计单位加强管理，提高专项资金的使用效率。
专项审计是什么意思？
专项审计是指针对公共财政资金的使用或管理等特定领域进行的审计。它通常是由在相关领域有专业知识和经验的审计人员进行的。专项审计的目的是发现和解决与财务相关的问题，确保资金的合法使用和维护公共财产的安全。与常规审计不同的是，专项审计在审计时局限于一定的范围和特定的问题。
专项审计的意义在于确保公共财产的保护和安全，以及保护公共利益。通过审计机构的专业能力和政府的公共管理体系，有效地推广了信息公开和透明度，保证了公共财产的合理运用，大大提高了政府的决策制定能力和行政效率。此外，专项审计可以揭示和解决政府在运作中出现的潜在问题，大幅度减少政府行政成本，提高政府运作的公信力。
专项审计的应用范围非常广泛。在公共财政领域，专项审计主要应用于政府公共财政资金的使用，包括中央和地方政府的预算执行、重点项目实施情况、财务管理、债务管理、税收收入和社保基金安全等方面。此外，专项审计还被广泛运用于各种组织机构，如企业、学校、医院、社会团体等，用以检查其财务和运营情况，确保其遵守法律法规和管理规定，为政府制定公共政策提供决策参考。
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