主要审计的内容有两项：
1、近三年研究开发费用专项审计：对企业申报前三年研发费用的合理性审计，最终符合要求的研发费用是否占企业营业的要求比例；
2、上年度高新技术产品（服务）专项审计：对企业申报上一年的高新技术产品（服务）收入的审计，最终符合要求的收入是否占企业总收入的60%以上。
企业社保专项审计涉及哪些内容
如果经专项审计检查发现有少报、瞒报缴费人数和缴费工资基数的缴费单位，除按规定补缴相应的社会保险费外，还将依法征收滞纳金、给予行政处罚。对有重大违法行为的缴费单位，由劳动保障行政部门向社会公布。虽然公告已经发出有一周的时间了，可有些企业对社保专项审计这项工作还不是很清楚，那么专项审计究竟审些什么？企业该做好哪些准备工作呢？对缴费单位社会保险费情况专项审计检查，简称为“专项审计”，是劳动保障部门社会保险基金行政监督机构，在基金征缴环节对参加社会保险统筹并缴纳社会保险费的用人单位的缴费情况，委托中介机构(会计师事务所)实施审计检查，并对经审计确认漏逃社会保险费予以追缴的监管过程。专项审计是由市政府拨出专门的资金对企业进行检查，因此企业不必担心审计会向企业收费的问题。● 专项审计的法律依据很多企业由于对政策的不了解，当专项审计检查到企业时，还不清楚国家对此项检查的有关法律依据，在此本报也将这些法规列举如下。一、《社会保险费征缴暂行条例》１９９９年国务院令第２５９号第五条规定：国务院劳动保障行政部门负责全国的社会保险费征缴管理和监督检查工作。县级以上地方各级人民政府劳动保障行政部门负责本行政区域内的社会保险费征缴管理和监督检查工作。第十三条规定：缴费单位未按规定缴纳和代扣社会保险费的，由劳动保障行政部门或者税务机关责令限期缴纳；逾期仍不缴纳的，除补缴欠缴数额外，从欠缴之日起按日加收千分之二的滞纳金。滞纳金并入社会保险基金。二、《劳动保障监察条例》２００４年国务院第４２３号令第十一条规定：劳动保障行政部门对下列事项实施劳动保障监察：(七)用人单位参加各项社会保险和缴纳社会保险费的情况；第十五条规定：劳动保障行政部门实施劳动保障监察，有权采取下列调查、检查措施：(五)委托会计师事务所对用人单位工资支付、缴纳社会保险费的情况进行审计。三、《北京市社会保险费征缴若干规定》２００３年市政府１３０号令其中第十四条规定：劳动保障行政部门可以委托会计师事务所对缴费单位缴纳社会保险 费的情况进行审核。
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