专项工程审计是确保工程项目合规、合理并达到经济效益的重要环节。审计内容主要涵盖三方面：
首先，审查工程项目的合法性与合理性。这包括检查工程计划是否全面，产品品种、产量、质量是否具备竞争优势，市场前景是否乐观，以及投资与还款计划是否可行。
其次，审查工程成本的计算与记录。重点在于验证成本计算原则的合规性，确保原始记录的真实性，特别是估工估料的准确性，并对工程成本表进行复核。
最后，进行工程清点盘存审查。这要求核对工程实际存在、支出明细账与企业盘存单是否一致，检查竣工后的余料是否办理退料手续，防止其被挪用或私用，同时对在建工程按完成度比例进行抽查，对无效益或报废工程进行原因分析。
审计的具体方法，是什么？
审计的具体方法是指审计程序，审计程序的类型包括：检查、观察、询问、函证、重新计算、重新执行、分析程序。
1、检查。是指注册会计师对被审计单位内部或外部生成的，以纸质、电子或其他介质形式存在的记录和文件进行审查，或对资产进行实物审查。
2、观察。是指注册会计师察看相关人员正在从事的活动或实施的程序。
3、询问。是指注册会计师以书面或口头方式，向被审计单位内部或外部的知情人员获取财务信息和非财务信息，并对答复进行评价的过程。
4、函证。是指注册会计师直接从第三方（被询证者）获取书面答复以作为审计证据的过程，书面答复可以采用纸质、电子或其他介质等形式。
5、重新计算。是指注册会计会计师对记录或文件中的数据计算的准确性进行核对。重新计算可通过手工或电子方式进行。
6、重新执行。是指注册会计师独立执行原本作为被审计内部控制组成部分的程序或控制。
7、分析程序。是指注册会计师通过分析不同财务数据之间以及财务数据与非财务数据之间的内在关系，对财务信息作出评价。另外，分析程序还包括在必要时对识别出的、与其他相关信息不一致或与预期值差异重大的波动或关系进行调查。
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